Dieses Problem kann entstehen, wenn Sie sich direkt über die Netzwerkverbindungen mit einem Netzlaufwerk verbinden. Haben Sie die Möglichkeit, dieses Laufwerk unter einem Laufwerksbuchstaben einzubinden? In Windows geht das per Rechtsklick auf den Arbeitsplatz und "Netzlaufwerk verbinden...". Alternativ könnten Sie auch probieren, ob das Problem noch auftritt, wenn Sie die Audio-Datei auf den lokalen Rechner kopieren und von dort mit der Transkription verknüpfen.
Der Quicktime-Player ist auf Windows übrigens meistens keine gute Alternative. Für WAV-Dateien ist der BAS-Audio-Player in allen Betriebssystemen die beste Wahl.